يقوم الصندوق بتنفيذ المشاريع واختيار المناطق بناءًا على الأسس التالية:            

1-      مبدأ المشاركة المجتمعية في المشروع.

2-      توفير فرص العمل لأبناء البادية وصقل المهارات والامكانات.

3-      المحافظة على البيئة والقبول الاجتماعي للمشروع.

4-      اعادة تأهيل النظام البيئي المتدهور.

5-      المحافظة على الموارد البيئية والاستدامة.

6-      امكانية تطبيق المشروع كنموذج ناجح والتوسع مستقبلاً.

7-      توافق المشروع مع احتياجات المجتمع المحلي.

8-      مراعاة المشروع لتقاليد أهل البادية والمحافظة على العادات.

9-      تقوية المجتمعات المحلية.

10-  توافق المشروع مع الخطط والاستراتيجيات الحكومية.